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染色体DNA参考序列是哪一条链

DNA是双链分子,按照A与T、C与G的原则互补配对。知道其中一条链,就可以反推出另外一条链。因此,在数据库中,染色体DNA参考序列都是单链。那么,染色体DNA参考序列是哪一条链呢?这是一个有趣而又不重要的问题。

Google了一下,国外还真有人讨论这个问题。地址如下
https://biology.stackexchange.com/questions/36595/what-is-the-strand-specificity-of-a-reference-genome
英文不难懂,建议大家去看原版,这里简单翻译一下。

对于具体的物种,最好去看数据库的说明。大概有如下原则:

  1. 细菌基因组和质粒
    原核生物大多为环状DNA,一个复制原点,两侧同时开始复制。数据库中的参考序列从复制原点左边的链5端开始的方向。

  2. 真核染色体
    对于知道染色体核型的情况,数据库中的染色体参考序列从短臂的5端开始。

  3. 单链RNA病毒
    单链RNA病毒的参考序列是正链”+”。